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澳研究人員用基因測(cè)序“修正”細(xì)菌分類(lèi)
2018-08-29 09:32:57 來(lái)源: 新華網(wǎng)
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  新華社悉尼8月29日電(陳宇)澳大利亞昆士蘭大學(xué)研究人員用基因測(cè)序技術(shù)繪制出細(xì)菌進(jìn)化樹(shù),這一方法有助于改進(jìn)以往的細(xì)菌分類(lèi)法。

  研究成果日前發(fā)表在英國(guó)《自然·生物技術(shù)》雜志上。研究人員主要使用一種被稱為元基因組學(xué)的方法,對(duì)自然環(huán)境中的細(xì)菌樣本直接進(jìn)行測(cè)序,進(jìn)而繪制出細(xì)菌進(jìn)化樹(shù),更好地對(duì)細(xì)菌進(jìn)行分類(lèi)。

  現(xiàn)有的生物分類(lèi)主要依據(jù)生物在形態(tài)結(jié)構(gòu)和生理功能等方面的特征,以弄清不同類(lèi)群之間的親緣關(guān)系和進(jìn)化關(guān)系。

  研究項(xiàng)目負(fù)責(zé)人、昆士蘭大學(xué)化學(xué)和分子生物科學(xué)學(xué)院教授菲利普·胡金霍爾茨說(shuō),盡管科學(xué)界總體認(rèn)可這種根據(jù)生物進(jìn)化關(guān)系來(lái)確定的分類(lèi),但因?yàn)榧?xì)菌難以根據(jù)物理特征區(qū)分,所以此前對(duì)細(xì)菌的分類(lèi)存在一些錯(cuò)誤。

  研究人員以細(xì)菌中最常見(jiàn)的120種基因圖譜為基礎(chǔ)繪制出龐大的細(xì)菌進(jìn)化樹(shù),以構(gòu)建一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)化的模型,修正以前的分類(lèi)錯(cuò)誤。

  例如,按照原先的分類(lèi)方法,只要是細(xì)胞內(nèi)部產(chǎn)生孢子的桿狀細(xì)菌都被歸入梭菌屬,而現(xiàn)在可以根據(jù)進(jìn)化樹(shù)將梭菌屬下的細(xì)菌重新分類(lèi)到29個(gè)科的121個(gè)不同的屬。

  研究團(tuán)隊(duì)中負(fù)責(zé)軟件開(kāi)發(fā)的博士多諾萬(wàn)·帕克斯說(shuō),隨著生物測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步,現(xiàn)在研究人員可以獲得成千上萬(wàn)種細(xì)菌的完整基因“藍(lán)圖”,包括一些目前還無(wú)法在實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)出的細(xì)菌。

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【糾錯(cuò)】 責(zé)任編輯: 尹世杰
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